CONTACT

Fabien ZOULIM

Direction d'équipe
fabien.zoulim@inserm.fr
04 72 68 19 70 (secrétariat)

Bâtiments Inserm
151 Cours Albert Thomas
69424 Lyon Cedex 03

ZOULIM Fabien
Professeur des Universités - Praticien Hospitalier (UCLB - HCL)
COVA Lucyna
BARTOSCH Birke
DURANTEL David
PARENT Romain
MICHELET Maud
Ingénieur d'étude Inserm
maud.michelet@inserm.fr
FRESQUET Judith
Ingénieur d'études Inserm
judith.fresquet@inserm.fr
JAMARD Catherine
Technicienne Inserm
catherine.jamard@inserm.fr
MOLLE Jennifer

Assistante Ingénieure
jennifer.molle@inserm.fr

LUCIFORA Julie
PLISSONNIER Marie-Laure
Chercheur post-doctorant
marie-laure.plissonnier@inserm.fr
TESTONI Barbara
Chercheur post-doctorant
barbara.testoni@inserm.fr
DIMIER Laura

AI

laura.dimier@inserm.fr

@inserm.fr
BEART Nicolas

M2

nicolas.beart@inserm.fr

@inserm.fr
MAADADI Sarah

IE

sarah.maadadi@inserm.fr

@inserm.fr
CHABROL Hélène

Etudiante en thèse

helene.chabrol@inserm.fr

@inserm.fr
LAVERDURE Noémie

M2

noemie.laverdure@chu-lyon.fr

@inserm.fr
PECHEUR Eve-Isabelle
GRIGOROV Boyan

Maître de Conférences / U. de Lyon
boyan.grigorov@inserm.fr


REUNGOAT Emma

Doctorante

emma.reungoat@inserm.fr

JALAGUIER Pascal

Post-doctorant

pascal.jalaguier@inserm.fr

CHARDES Brieux

M2

brieux.chardes@inserm.fr

BONNIN Marc

Post-doctorant

marc.bonnin@inserm.fr

D'ARIENZO Valentina

Post-doctorant

valentina.darienzo@inserm.fr

GAILLARD Julien

Post-doctorant

julien.gaillard@inserm.fr


FAURE-DUPUY Suzanne

Doctorante

suzanne.faure@inserm.fr

LOCATELLI Maëlle

Doctorante

maelle.locatelli@inserm.fr

ALFAIATE Dulce

Post-doc

dulce.alfaiate@inserm.fr

FOCA Adrien

M2

adrien.foca@inserm.fr

AILLOT Ludovic

Etudiant en thèse

ludovic.aillot@inserm.fr


COMBET Christophe

CR1 CNRS

christophe.combet@inserm.fr

LAHLALI Thomas

Post-doc

thomas.lahlali@inserm.fr

CROUY Stéphanie

ARC

stephanie.crouy@inserm.fr

QUINET Jonathan

M2

jonathan.quinet@inserm.fr

VEGNA Serena

Post-doc

serena.vegna@inserm.fr

CAPETTE Solene

M2

solene.capette@etu.univ-lyon1.fr

DUPONCHEL Sarah

Post-doctorante

sarah.duponchel@inserm.fr

Voir les objectifs et projets Voir les publications

Collaborations
Prof. Michel Ovize / Dr. Jennifer Rieusset, UMR1060, Lyon, France
Dr Uzma Hasan and Dr Thomas Henry, University of Lyon, INSERM U81 and Finovi Team, Lyon, France
Dr Massimo Tommasino and Dr Pierre Hainaut/Andre Da Costa and Dr Herceg, IARC, Lyon France
Dr. Marie-Louise Michel, Institut Pasteur, Paris
Prof. Helmut Diepolder, Klinikum Universitaet München, München, Allemagne
Prof. Ulrike Protzer, Institute for Virology, München, Allemagne
Dr. Margarethe Odenthal, Institute of Pathology, Köln, Allemagne
Prof. Massimo Levrero, University « La Sapienza », Roma, Italie
Prof. Peter Nielsen, Université de Copenhague, Danemark
Prof. Mark Thursz, Imperial College, London, UK
Dr Nicole Zitzmann, Institut de Glycobiologie, Université d’Oxford, Oxford, UK
Prof. Abraham Brass, Harvard Medical School, MA, USA
Dr Ourania Andrisani, Université de Purdue, IN, USA
Prof. Vitor Faça, Université de San Paulo, Brézil

Financements Nationaux
Institut Hospitalo-Universitaire (IHU) OPERA: Organ Damage and Repair (2012-2015)
ANR CYDIACOR: Involvement of cyclophilin D in blood glucose regulation and diabetic myocardial contractile dysfunction (2013-2015)
Ministère de la Santé – Centre de Recherche Clinique (2011-2015)
Fondation pour la Recherche Médicale, Equipe FRM : Caractérisation de la réponse immunitaire innée de l’hépatocyte contre l’infection par HBV (2011-2014)
Institut Universitaire de France (2009-2014)
ANRS (Agence nationale pour la recherche sur le sida): Financements réguliers pour les projets et des bourses doctorales/postdoctorales
Finovi (Fondation "Innovations en Infectiologie", 2014-2016): VHB & immunité innée (2 projets)

Financements Internationaux
PROLIFICA - European Community - FP7: Prévention de la fibrose et le cancer du foie en Afrique (2011-2014)
Marie-Curie International Reintegration Grants – FP7 people: Hepatitis C virus virion-bound proteins : identification in clinical samples and in vitro dissection of their importance in the viral life cycle (2009-2014)
HEPACUTE - European Community - FP7: Host and viral factors in acute hepatitis C (2010-2013)
NIH (R01) : Mécanisme de la transformation des hépatocytes par la protéine HBx d’HBV (2012-2015)

OBJECTIFS

Les virus des hépatites B et C sont responsables d’infections chroniques chez près de 600 millions de personnes dans le monde et favorisent le développement d’atteinte hépatique (stéatose et fibrose) pouvant conduire à la cirrhose et au carcinome hépatocellulaire (CHC). Les objectifs principaux de l’équipe sont de mieux comprendre les mécanismes moléculaires qui permettent l’établissement et le maintien des infections persistantes par les virus des hépatites B et C. Une meilleure compréhension de ces mécanismes devrait permettre le développement de nouvelles stratégies antivirales (directe ou par stimulation du système immunitaire) visant à l’éradication des infections virales et la prévention (CHC) ou la régression (stéatose, fibrose) des pathologies associées.

PROJECTS

Hépatites B et C : pathogenèse et nouveaux traitements
Pour développer de nouvelles stratégies de prévention du CHC induit par HBV, il est indispensable de comprendre qu’elles sont pour ce virus les possibilités d'échappement initial et chronique à la pression immune et antivirale, induisant une tolérance immune et la persistance virale. L'étude des interactions virus-cellules et la caractérisation de la réponse immunitaire innée de l'hépatocyte à HBV devraient en effet contribuer à identifier les mécanismes impliqués dans la persistance virale et la transformation cellulaire. Par ailleurs, de nouvelles stratégies d'immunisation de patients infectés chroniquement par HBV et sous antiviraux sont aussi évaluées avec pour objectif d'augmenter les réponses T spécifiques.

> LIRE LA SUITE

GROUPE B. BARTOSCH

“Hepatitis C virus-induced metabolic reprogramming and pathological consequences” 

Hepatocellular carcinoma (HCC) is the fifth most common and third deadliest tumor. Circa 75% of HCC cases are due to chronic hepatitis B and C infection, but features of the metabolic syndrome including obesity, dyslipidaemia, insulin resistance and type 2 diabetes mellitus are also important risk factors. Furthermore, the virus has been shown to directly induce insulin resistance and steatosis in patients. Thus metabolic dysfunctions are an important feature of chronic hepatitis C. To understand how HCV reprograms the hepatic glucose and lipid metabolism on the molecular level is highly important because these changes lead to the establishment of a vicious cycle between oxidative stress, mitochondrial dysfunctions and cytokine signaling. The resulting chronic inflammation drives fibrosis and leads on the long term to cirrhosis and hepatocarcinogenesis. Analysis of the HCV-induced metabolic reprogramming and its role in the vicious cycle between oxidative stress, mitochondrial dysfunction and inflammation will help us to further understand the life cycle of HCV and to alleviate HCV-induced metabolic dysfunctions and their pathological consequences via the identification of novel viral and/or cellular targets for new generations of anti-HCV drugs. These investigations will also help to refine modalities of management and guide treatment decisions – in respect to timing and type of treatment for chronic hepatitis C. Finally, these studies will also contribute to our understanding of the roles of obesity and diabetes, which are reaching epidemic proportions worldwide, in human disease. 

> LIRE LA SUITE

GROUPE L.COVA, D.DURANTEL, F.ZOULIM

Projet : Dr Lucyna Cova (DR2 INSERM), Dr David Durantel (CR1 INSERM), et Pr Fabien Zoulim (PU/PH) 

Les traitements des hépatites B ne permettent pas en général d’éradiquer le virus car une des formes de la réplication virale, l’ADNccc (covalently closed circular DNA), n’est pas ou très lentement éliminée. Une autre cause de l’échec thérapeutique est la résistance virale qui apparaît en cas de traitements prolongés. Une possibilité pour améliorer ces traitements pourrait consister à introduire un élément immuno-thérapeutique (vaccin thérapeutique ou autres stimulants de l’immunité innée et adaptative) dans une nouvelle combinaison. Pour pouvoir développer une telle approche, il est indispensable de comprendre comment le virus est capable d’inhiber la réponse immunitaire de l’hôte, notamment la réponse immunitaire innée. 

> LIRE LA SUITE

GROUPE R. PARENT

Axe 1 : Composition protéique des particules virales du VHC d’origine clinique



Preparation purifiées de particules du VHC visualisée par microscopie électronique après coloration négative. La population hétérogène visible regroupe des particules enveloppées d’environ 70nm et des nucléocapsides nues d’environ 30 à 40 nm, probablement associées à des propriétés biologiques très différentes.

> LIRE LA SUITE

GROUPE E-I PECHEUR

Héparanes sulfates protéoglycanes du microenvironnement hépatocytaire dans l’infection et la carcinogenèse précoce induite par les virus hépatotropes B, C et delta.

Les hépatites virales chroniques sont à l'origine de 75% des cas de carcinome hépatocellulaire (CHC), le 2ième cancer le plus léthal après le cancer du poumon et le 5ième en terme d'incidence mondiale. Aucune thérapie n'est réellement efficace contre le CHC, la seule option restant la transplantation hépatique. Le virus de l'hépatite C (HCV) infecte chroniquement 180 millions d'individus, et bien que des traitements antiviraux efficaces soient actuellement disponibles, certains patients restent difficiles à traiter et en grand risque de développer un CHC. Les hépatites B et delta affectent respectivement 350 et 20 millions de personnes. Dues aux virus de l'hépatite B (HBV) et delta (HDV), elles posent des problèmes de santé publique du fait de la diversité des génotypes viraux, leur dissémination rapide, la sévérité des dommages hépatiques, l'émergence de variants viraux résistants, le contrôle pharmacologique insuffisant avec les thérapies actuelles et l'accès variable à des traitements coûteux.

> LIRE LA SUITE

GROUPE C. COMBET

Notre groupe effectue des recherches sur les cancers induits par des agents pathogènes par des moyens de la bioinformatique. Nous sommes particulièrement intéressés par le carcinome hépatocellulaire induit par les virus de l'hépatite B et C (VHB and VHC). 

Nos activités couvrent :
- le développement des bases de données intégrant les séquences, structures et fonctions des macromolécules biologiques
- l’intégration d’outils bioinformatiques pour l’analyse des séquences et structures de protéines à travers des serveurs Web
- l’analyse de données de séquençage haut-débit (NGS)
- la bioinformatique structurale des protéines
- la bioinformatique appliquée

> LIRE LA SUITE

PUBLICATIONS

Luangsay S, Gruffaz M, Isorce N, Testoni B, Michelet M, Faure-Dupuy S, Maadadi S, Ait-Goughoulte M, Parent R, Rivoire M, Javanbakht H, Lucifora J, Durantel D, Zoulim F. Early inhibition of hepatocyte innate responses by hepatitis B virus.  J Hepatol. 2015 Jul 26. pii: S0168-8278(15)00477-8. doi: 10.1016/j.jhep.2015.07.014. [Epub ahead of print]

Luangsay S, Ait-Goughoulte M, Michelet M, Floriot O, Bonnin M, Gruffaz M, Rivoire M, Fletcher S, Javanbakht H, Lucifora J, Zoulim F, Durantel D.
Expression and functionality of Toll- and RIG-like receptors in HepaRG cells. J Hepatol. 2015 Nov;63(5):1077-85. doi: 10.1016/j.jhep.2015.06.022. Epub 2015 Jul 3.

Reddy KR, Zeuzem S, Zoulim F, Weiland O, Horban A, Stanciu C, Villamil FG, Andreone P, George J, Dammers E, Fu M, Kurland D, Lenz O, Ouwerkerk-Mahadevan S, Verbinnen T, Scott J, Jessner W. Simeprevir versus telaprevir with peginterferon and ribavirin in previous null or partial responders with chronic hepatitis C virus genotype 1 infection (ATTAIN): a randomised, double-blind, non-inferiority phase 3 trial. Lancet Infect Dis. 2015 Jan;15(1):27-35. doi: 10.1016/S1473-3099(14)71002-3. Epub 2014 Dec 5. PubMed PMID: 25482330.
  
Zoulim F, Carosi G, Greenbloom S, Mazur W, Nguyen T, Jeffers L, Brunetto M, Yu S, Llamoso C. Quantification of HBsAg in nucleos(t)ide-naïve patients treated for chronic hepatitis B with entecavir with or without tenofovir in the BE-LOW study. J Hepatol. 2015 Jan;62(1):56-63. doi: 10.1016/j.jhep.2014.08.031. Epub 2014 Aug 28. PubMed PMID: 25176615.

Brault C, Lévy P, Duponchel S, Michelet M, Sallé A, Pécheur EI, Plissonnier ML, Parent R, Véricel E, Ivanov AV, Demir M, Steffen HM, Odenthal M, Zoulim F, Bartosch B. Glutathione peroxidase 4 is reversibly induced by HCV to control lipid peroxidation and to increase virion infectivity. Gut. 2014 Dec 16. pii: gutjnl-2014-307904. doi: 10.1136/gutjnl-2014-307904. [Epub ahead of print] PubMed
PMID: 25516417.
  
Charuworn P, Hengen PN, Aguilar Schall R, Dinh P, Ge D, Corsa A, Reesink HW, Zoulim F, Kitrinos KM. Baseline Interpatient Hepatitis B Viral Diversity Differentiates HBsAg Outcomes in Patients Treated With Tenofovir Disoproxil Fumarate. J Hepatol. 2014 Dec 13. pii: S0168-8278(14)00926-X. doi: 10.1016/j.jhep.2014.12.008. [Epub ahead of print] PubMed PMID: 25514556.
  
Arends P, Sonneveld MJ, Zoutendijk R, Carey I, Brown A, Fasano M, Mutimer D, Deterding K, Reijnders JG, Oo Y, Petersen J, van Bömmel F, de Knegt RJ, Santantonio T, Berg T, Welzel TM, Wedemeyer H, Buti M, Pradat P, Zoulim F, Hansen B, Janssen HL; for the VIRGIL Surveillance Study Group. Entecavir treatment does not eliminate the risk of hepatocellular carcinoma in chronic hepatitis B:limited role for risk scores in Caucasians. Gut. 2014 Jul 10. pii: gutjnl-2014-307023. doi: 10.1136/gutjnl-2014-307023. [Epub ahead of print] PubMed PMID: 25011935.

Lucifora J, Xia Y, Reisinger F, Zhang K, Stadler D, Cheng X, Sprinzl MF, Koppensteiner H, Makowska Z, Volz T, Remouchamps C, Chou WM, Thasler WE, Hüser N, Durantel D, Liang TJ, Münk C, Heim MH, Browning JL, Dejardin E, Dandri M, Schindler M, Heikenwalder M, Protzer U. Specific and nonhepatotoxic degradation of nuclear hepatitis B virus cccDNA. Science. 2014 Mar 14;343(6176):1221-8. doi:  10.1126/science.1243462. Epub 2014 Feb 20. PubMed PMID: 24557838.

Lavocat F, Deny P, Pichoud C, Al Hawajri N, Kitrinos K, Borroto-Esoda K, Zoulim F. Similar evolution of hepatitis B virus quasispecies in patients with incomplete adefovir response receiving tenofovir/emtricitabine combination or tenofovir monotherapy. J Hepatol. 2013 Jun 3. Jordheim LP, Durantel D, Zoulim F, Dumontet C. Advances in the development of nucleoside and nucleotide analogues for cancer and viral diseases. Nat Rev Drug Discov. 2013 Jun;12(6):447-64. 

Simonin Y, Vegna S, Akkari L, Gregoire D, Antoine E, Piette J, Floc'h N, Lassus P, Yu GY, Rosenberg AR, Karin M, Durantel D, Hibner U. Lymphotoxin signaling is initiated by the viral polymerase in HCV-linked tumorigenesis. PLoS Pathog. 2013 Mar;9(3):e1003234. 

Accardi R, Fathallah I, Gruffat H, Mariggi√≤ G, Le Calvez-Kelm F, Voegele C, Bartosch B, Hernandez-Vargas H, McKay J, Sylla BS, Manet E, Tommasino M. Epstein - Barr virus transforming protein LMP-1 alters B cells gene expression by promoting accumulation of the oncoprotein ΔNp73α. PLoS Pathog. 2013 Mar;9(3):e1003186. 

Lacombe K, Boyd A, Lavocat F, Pichoud C, Gozlan J, Miailhes P, Lascoux-Combe C, Vernet G, Girard PM, Zoulim F. High incidence of treatment-induced and vaccine-escape hepatitis B virus mutants among human immunodeficiency virus/hepatitis B-infected patients. Hepatology. 2013 Mar 6. 

Jammart B, Michelet M, Pecheur EI, Parent R, Bartosch B, Zoulim F, Durantel D. Very-low-density lipoprotein (VLDL)-producing and hepatitis C virus-replicating HepG2 cells secrete no more lipoviroparticles than VLDL-deficient Huh7.5 cells. J Virol. 2013 May;87(9):5065-80. 

Hayer J, Jadeau F, Deleage G, Kay A, Zoulim F, Combet C. HBVdb: a knowledge database for Hepatitis B Virus. Nucleic Acids Res. 2013 Jan;41(Database issue):D566-70. 

Gish R, Jia JD, Locarnini S, Zoulim F. Selection of chronic hepatitis B therapy with high barrier to resistance. Lancet Infect Dis. 2012 Apr;12(4):341-53. 

Billioud G, Pichoud C, Parent R, Zoulim F. Decreased infectivity of nucleoside analogs-resistant hepatitis B virus mutants. J Hepatol. 2012 Jun;56(6):1269-75. 

Zoulim F. Hepatitis: Treatment failure in chronic hepatitis B. Nat Rev Gastroenterol Hepatol. 2011 Jul 4;8(7):366-7.

CENTRE DE RECHERCHE EN CANCEROLOGIE DE LYON (CRCL)
UMR INSERM 1052 CNRS 5286 - CENTRE LEON BERARD
Copyright 2011. CRCL
SUIVEZ LES ACTUALITES
DU CRCL SUR TWITTER :